磁星骑士描述的是在人类居住的五行洲之外还有一个精灵的世界叫恒磁星恒磁星的长老发现邪恶的红骑士妄图破坏两个世界于是向五行洲派出了磁星精灵远征队寻找能够拯救两个世界的磁星骑士没想到被选中的磁星骑士居然是散漫的阿峰活在因事故死去的哥哥阴影中的向东缺少父母陪伴的富家千金雅玲和从小失去双亲性格孤僻懦弱的茉莉这四个普通学生最初缺乏使命感但在与邪恶分子的斗争中逐渐克服了各自的缺点齐心协力获得了胜利成为了真正的磁星骑士
故事将以赛马娘们与练马师梦寐以求一生只能挑战一次的经典三冠比赛皋月赏日本赛马菊花赏为主题描述成田路爱慕织姬好歌剧等被称作三强的赛马娘将抱着绝不认输的思绪朝着顶点进发
『サクラ大戦』『機動新撰組 萌えよ剣』などの近代日本をモチーフとした作品で知られる広井王子が原作・総指揮を担当したアニメ作品『新機動武闘伝Ｇガンダム』『ジャイアント・ロボ THE ANIMATION』などで知られる今川泰宏が原作・構成・シナリオを担当した意欲作でもある 大艦巨砲時代の日本をモチーフとした「我が国」を舞台に超能力を持つ少女を集めた海軍特殊部隊「バージンフリート」候補生たちの奮闘を描くごく普通の女学生・海野潮風はある時超能力「バージンパワー」の高さを見込まれ新生バージンフリート隊の候補生となるだがお嫁さんに憧れる潮風は未婚を強いられるバージンフリートへの参加に思い悩むのだった
