POLYPHONICA是一个被称为精灵的生命也存在的异世界与地球上存在的世界同属于平行世界从地球被POLYPHONICA大陆传唤的人类也在这个世界生活POLYPHONICA大陆的科学水平是地球的现代近未来的水准与地球现代科学产物同样的东西也基本存在以外所谓的未来城市也一样存在与之平行的是借助演奏神曲的精灵力量这样的技术体系也同时发展着似乎在这个世界隐藏着极大的秘密精灵和人类不知不觉就面临着真相揭晓的那个时候……
『サクラ大戦』『機動新撰組 萌えよ剣』などの近代日本をモチーフとした作品で知られる広井王子が原作・総指揮を担当したアニメ作品『新機動武闘伝Ｇガンダム』『ジャイアント・ロボ THE ANIMATION』などで知られる今川泰宏が原作・構成・シナリオを担当した意欲作でもある 大艦巨砲時代の日本をモチーフとした「我が国」を舞台に超能力を持つ少女を集めた海軍特殊部隊「バージンフリート」候補生たちの奮闘を描くごく普通の女学生・海野潮風はある時超能力「バージンパワー」の高さを見込まれ新生バージンフリート隊の候補生となるだがお嫁さんに憧れる潮風は未婚を強いられるバージンフリートへの参加に思い悩むのだった
