九重天危机后世界又恢复了一派安宁景象当今社会手机电脑等电子设备成为了人们的生活必需品网络信号覆盖全球有很多人沉迷其中忽略现实生活导致生理心理疾病甚至道德败坏这成为了现代社会的顽疾也让地球成为了黑暗势力的新目标病毒机械兽来袭地球散播黑晶黑晶像蒲公英一样飘入人们的电子设备屏幕里吸收能量后吞噬屏幕面前的人使普通人变成黑士兵而一些沉迷网络或有网络恶习的人变成机械兽
宇宙历八世纪末帝国历五世纪末在卡布契兰加行星之战建立功勋的莱茵哈特·冯·缪杰尔获得基地副司令官推荐晋升中尉成为宇宙舰队哈梅隆二号驱逐舰的航海长好友齐格飞·吉尔菲艾斯也晋升少尉成为该舰的保安主任出身贵族加之年纪尚轻两位好友甫一到来招致上到副舰长下到二等兵的颇多非议和不信任莱茵哈特和吉尔菲艾斯凭借勇猛果敢与超越阶级的平等观念赢得下级士兵的尊重在航行至亚特密尔恒星系时哈梅隆二号遭遇自由行星同盟舰队的伏击身受重伤的舰长临时将指挥权交予莱茵哈特但副舰长则强硬坚持自己的理念少年英雄的建功之路荆棘重重…… 本片根据田中芳树的经典科幻小说改编